Электрофорез нуклеиновых кислот

Агароза с низким EEO — полисахарид, используемый для разделения нуклеиновых кислот по размерам при электрофорезе в агарозном геле. Идеально подходит для расщепления фрагментов ДНК и РНК от 50 п.н. до >30 кб.

Особенности

• Идеально подходит для анализа и восстановления ДНК и РНК в обычных условиях;
• прочная гелевая структура обеспечивает лучшую управляемость и меньшую ломкость.

• рекомендуется использовать 0,5 буфера TBE (арт. G3002) или 1 буфер TAE (арт. G3001) для приготовления соответствующего количества гелевого препарата и буфера для электрофореза;
• в зависимости от количества геля и концентрации геля соответствующее количество порошка агарозы добавляют в стеклянную коническую колбу, содержащую определенное количество буфера для электрофореза (объем добавляемого буфера для электрофореза не должен превышать 50% емкости конической колбы).
• коническую колбу, накрытую сверху полиэтиленовой пленкой и помещают в микроволновую печь для нагревания и растворения агарозы.
• к агарозе следует добавить соответствующее количество красителей на основе нуклеиновых кислот, таких как нетоксичный краситель на основе нуклеиновых кислот SerRed (арт. G3606) или бромид этидия EB (арт. G3010), когда раствор остынет примерно до 50 °C его следует хорошо перемешать.
• раствор наливают в форму для заливки геля. Не касаясь дна формы помещают гребенки. Толщина геля обычно контролируется в пределах 3-5 мм.
• агарозный гель может затвердевать примерно за 30 минут при комнатной температуре (время затвердевания различных концентраций геля различно и подбирается в зависимости от реальной ситуации).

10-кратный буфер для загрузки образцов ДНК в гель, содержит красный краситель в качестве индикатора движения образца ДНК. Миграция красителя в 1×TAE буфере и 1% агарозном геле примерно 370 пн, и в 1×TBE буфере и 1% агарозном геле примерно 220 пн.

Условия хранения и транспортировки: при комнатной температуре, срок годности — 24 мес.

Фасовка, мл — 1.

dsGreen — безопасный краситель, используемый в целях регистрации НК в гелях при электрофорезе (агарозных или ПААГ).

dsGreen проявляет себя как избирательный в направлении ДНК краситель, без явной мутагенности. Возбуждение происходит благодаря ультрофиолетовому, либо синиму свету. Чувствительность dsGreen выше аналогичного бромистого этидия: 0,08 нг на полосу для ДНК против 2 нг на полосу.

Продукт поставляется в виде сухого оранжевого вещества в герметичной пробирке. Твердый вид продукта способствует длительному сроку хранения. При соблюдении условий хранения (защищенное от света место и температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 24 месяца или 2 года.

dsGreen — безопасный краситель, используемый в целях регистрации НК в гелях при электрофорезе (агарозных или ПААГ).

dsGreen проявляет себя как избирательный в направлении ДНК краситель, без явной мутагенности. Возбуждение происходит благодаря ультрофиолетовому, либо синиму свету. Чувствительность dsGreen выше аналогичного бромистого этидия: 0,08 нг на полосу для ДНК против 2 нг на полосу.

Продукт поставляется в виде оранжевого жидкого вещества в герметичной пробирке. При соблюдении условий хранения (защищенное от света место и температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 12 месяцев или 1 год.

dsSafe — безопасный краситель, используемый в целях регистрации НК в гелях при электрофорезе (агарозных или ПААГ). dsSafe проявляет себя как избирательный в направлении ДНК краситель, без явной мутагенности. Возбуждение происходит благодаря ультрофиолетовому, либо синиму свету. Это может быть полезно, так как фоновая засветка будет ниже при голубом свет, чем при УФ. Также ДНК не подвергается излишниму излучению, что способствует увеличению результативности клонирования.

Продукт поставляется в виде оранжевого жидкого вещества в герметичной пробирке. При соблюдении условий хранения (защищенное от света место и температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 24 месяца или 2 года.

Бромистый этидий является наиболее часто используемым красителем нуклеиновых кислот в акриламидном и агарозном геле. Флуоресценция красителя увеличивается в 21 раз при связывании с двухцепочечной РНК и в 25 раз при связывании с двухцепочечной ДНК.

Упаковка – 5 г в стеклянной бутылке.

Краситель Hi-SYBr Safe представляет собой инновационное решение, разработанное в качестве более безопасной альтернативы бромиду этидия для окрашивания нуклеиновых кислот в процессе гель-электрофореза.

Этот краситель позволяет визуализировать гель как с помощью УФ-трансиллюминатора, так и с использованием трансиллюминатора синего света. Он способен обнаруживать двухцепочечные фрагменты ДНК (dsDNA) в концентрации до 0,1 нг при проведении электрофореза.

Hi-SYBr Safe обладает высокой специфичностью к дцДНК и обеспечивает незначительный фоновый сигнал. Его чувствительность в 10 раз превосходит чувствительность бромида этидия.

Краситель поставляется в виде раствора в диметилсульфоксиде (ДМСО) с концентрацией 10'000х.

Условия хранения: при температуре ‐ 20 °C, защищенный от света в эксикаторе.

• Цвет — красный.
• Концентрация основного вещества, мг/мл — 5.
• Чистота, % — 97 (HPCE).
• Длина волны возбуждения флуоресценции, нм — 520.
• Длина волны испускания флуоресценции, нм — 560.
• Температура вспышки, °С — 87.
• Условия хранения, °С — 2-8, в темном месте.

ProteOrange — краситель, применяемый в гелях, с целью регистрации белков, методом избирательного взаимодействия с белками в условиях наличия НК, полисахаридов и др. молекул. Данный краситель проявляет чувствительность выше (выявляет 3 нг белка), чем аналог Кумасси (бриллиантовый синий), выявляющий примерно 30 нг белка в полоске. При этом он взаимодействует с белковой оболочкой, состоящей из додецилсульфата натрия, уменьшая вариабельность прокрашивания разных белков.

Продукт продается в виде оранжевого жидкого вещества в герметичной пробирке. При соблюдении условий хранения (защищенное от света и влаги место, температура -20 °C) краситель имеет срок хранения 24 месяца или 2 года.

Краситель R24 для нанесения образцов РНК на гель используется для приготовления образцов РНК для нанесения на полиакриламидный или агарозный гель. Содержит два красителя для оценки подвижности нуклеиновой кислоты в геле: бромфеноловый синий и ксиленцианол FF для визуализации фрагментов во время гель-электрофореза и интеркалирующий краситель бромистый этидий. Содержит денатурирующий агент формамид, который позволяет разделять фрагменты РНК даже при не денатурирующем электрофорезе, а также стабилизирует РНК.

Краситель SerRed — предназначен для окрашивания дцДНК, ssDNA или РНК в агарозных гелях или полиакриламидных гелях, наиболее чувствителен к дцДНК.

Преимущества красителя SerRed

• чувствительность выше, чем у бромистого этидия;
• нетоксичен;
• термостабилен: можно добавлять непосредственно в горячий агарозный раствор;
• совместим со всеми стандартными буферами для электрофореза.

Примечание: холодное хранение не требуется, хранить при комнатной температуре во избежание выпадения осадка, при наличии осадка нагреть краситель SerRed до 45-50 °С в течение 2 мин и перемешать до растворения осадка.

Условия хранения: при комнатной температуре в защищенном от света месте.

• Цвет — оранжевый.
• Длина волны возбуждения флуоресценции, нм — 300 (УФ), 495 (голубой).
• Длина волны испускания флуоресценции, нм — 537 (желтый).
• Температура вспышки, °С — 87.
• Условия хранения — -20 °C, в темном месте.

Краситель Ultra GelRed предназначен для окрашивания дцДНК, оцДНК или РНК в агарозном геле или полиакриамидном геле, менее токсичен, чем бромистый этидий, имеет высокую термостабильность и высокую чувствительностью к обнаружению следовых количеств ДНК, особенно следовой низкомолекулярной ДНК. Под ультрафиолетовым светом, ДНК проявляет красную флуоресценцию.

Преимущества красителя Ultra GelRed

• Нетоксичный: макромолекулярные характеристики красителя Ultra GelRed делают его неспособным проходить клеточную мембрану и проникать в клетки;
• широкий спектр применений: подходит для электрофореза в агарозном геле или полиакриламидном геле; может использоваться для окрашивания дцДНК, оцДНК и РНК;
• высокая чувствительность: подходит для окрашивания электрофорезом различных размеров и очень чувствителен к низким концентрациям и следовым количествам ДНК;
• сильный флуоресцентный сигнал образца с низким фоновым сигналом;
• высокая стабильность: обладает той же стабильностью, что и бромистый этидий, и не разлагается во время подготовки геля и электрофореза.

Условия хранения: 15-25 °С, в защищенном от света месте.

Реагент для приготовления образцов ДНК и маркеров для электрофореза в агарозном или полиакриламидном геле. Содержит цветные маркерные красители Бромфеноловый синий и ксиленцианол FF для визуального контроля за миграцией фрагментов ДНК в геле. Также в состав реагента входят глицерин в качестве утяжеляющего агента и ЭДТА в качестве ингибитора нуклеаз.

Не мешает визуализации ДНК в ультрафиолете.

10 мM Tрис-HCl (pH 7,6), 0,03% бромфеноловый синий, 0,03% ксиленцианол FF, 60% глицерин, 60 мM ЭДТА.