Набор реагентов SG GM Plus представляет собой усовершенствованное решение для полной подготовки секвенирующих библиотек по методу дробления (Shotgun Sequencing). Технология основана на ферментативной фрагментации ДНК, которая позволяет получать фрагменты заданного размера, начиная от 130 п.н., из различных типов исходного материала — геномной ДНК или ДНК-ампликонов длиной свыше 800 п.н. Ключевым преимуществом набора является встроенная оптимизация протокола за счет включения магнитных частиц для очистки, что значительно сокращает общее время подготовки проб и минимизирует риски потери материала. Набор обеспечивает высокую воспроизводимость результатов при работе с широким диапазоном входных количеств ДНК: рекомендуется 200 нг для геномной ДНК и 100 нг для ПЦР-продуктов.
Особенности набора ShotGun Plus, SG GM Plus
- Путем варьирования времени ферментативной фрагментации существует возможность регулирования размеров получаемых фрагментов;
- обработка фрагментированной ДНК не требует проведения стадии очистки после завершения этапа фрагментации;
- процессы репарации и лигирования выполняются последовательно в одной реакционной пробирке;
- очистку после стадии лигирования рекомендуется выполнять с применением парамагнитных частиц по технологии SPRI (метод селекции ДНК по длине, применяемый для выделения фрагментов ДНК заданного размерного диапазона из смеси фрагментов различной длины);
- введение индексов в библиотеку осуществляется методом ПЦР, индексные праймеры обладают совместимостью с праймерами платформы Illumina TrueSeq;
- оптимальное количество циклов амплификации — 8.
Состав набора ShotGun Plus, SG GM Plus
- 3 в 1 буфер;
- 3-фермент;
- ДНК-нуклеаза;
- лигазный буфер;
- лигаза;
- адаптеры;
- ПЦР буфер;
- ПЦР фермент 1;
- ПЦР фермент
- элюирующий буфер;
- магнитные частицы.
Обратите внимание, что следующие компоненты, необходимые для завершения подготовки библиотек, в комплект не входят и приобретаются отдельно.
Праймеры для индексирования: комплекты уникальных праймеров (#Plate1_SG_GM и #Plate2_SG_GM), необходимые для введения индексов и последующего объединения (мультиплексирования) образцов в одном потоке секвенирования на платформах Illumina.
Условия хранения: для всех компонентов набора SG GM Plus требуется соблюдать температурный режим хранения -20 °C, срок годности — 12 мес.
