Функция Acclaro обеспечивает спектрофотометрам NanoDrop, Thermo FS уникальную способность точного определения концентрации РНК, ДНК, белков, независимо от примесей!

Сравнение концентрации нуклеиновой кислоты в образце с использованием функции Acclaro и без неё

Спектрофотометры без функции Acclaro могут показывать завышенные концентрации нуклеиновых кислот (рис. 1 красные столбцы), так как не учитывают влияния контаминантов на концентрацию целевого вещества. Это в дальнейшем может повлиять на результат эксперимента.

Рис. 1. Концентрация с поправкой на Acclaro находится в пределах 10% от фактической концентрации ДНК для всех смесей. «Контрольная» линия – концентрация для контрольной ДНК (образец № 1 это фактическая концентрация двухцепочечной ДНК). Каждая точка данных представляет собой среднее значение пяти измерений.

Контаминанты, которые может обнаружить технология Acclaro Contaminant ID (Целевое вещество – примесь):

• двуцепочечная ДНК – детекция белка, фенола, гуанидина гидрохлорида в образцах;
• РНК – детекция белка, фенола и изотиоцианата гуанидина;
• белок – детекция ДНК.

Библиотека спектров примесей пополняется производителем.

Как интерпретировать результаты идентификации контаминации Acclaro?

Алгоритмы Acclaro основаны на справочной библиотеке спектров. Затем эти алгоритмы анализируют спектр образца, и программное обеспечение оценивает вероятность контаминации относительно спектра образцов контаминации с использованием хемометрических математических принципов. Идентификация контаминантов возможна при изменении двуцепочечной ДНК, РНК и белков на длине волны 280 Å.

Ниже показано, как функция Acclaro Contaminant ID на спектрофотометрах NanoDrop обнаруживает контаминацию в образцах нуклеиновых кислот и белков.

Спектрофотометр определяет контаминант в режиме реального времени, отображая значок идентификации контаминации (рисунок 2) рядом с номером образца. При нажатии на значок контаминанта отображаются данные анализа контаминации с использованием алгоритмов Acclaro (рисунок 2). На экране отображаются идентифицированные контаминанты, скорректированная концентрация нуклеиновой кислоты или белка и % коэффициента вариации, который представляет достоверность прогноза алгоритмов Acclaro.

		Значок идентификации контаминации Acclaro: алгоритм Acclaro обнаружил контаминацию в этом образце двухцепочечной ДНК.
		Оригинал: измеренная концентрация без коррекции Acclaro (синий спектр)
		Коррекция: измеренная концентрация с коррекцией (зеленый спектр)
		Контаминация: обнаружена контаминация и высчитано, сколько она привносит в спектр на длине 260 нм

Рис. 2. Интерпретация результатов с использованием технологии Acclaro.

На экране Acclaro Contaminant Analysis представлена информация об образце (рис. 2).

В верхней строке представлены соотношения исходной концентрации и чистоты. Это расчетный результат концентрации (исходный) до внесения поправок на контаминацию.

Во второй строке с надписью «Corrected» показаны два значения. Первое значение – скорректированная концентрация анализируемого образца в нг/мкл (в примере это двухцепочечная ДНК, указано в левом нижнем углу экрана). Второе значение — это коэффициент вариации (СV) выраженный в %, чем ниже % CV, тем больше достоверна скорректированная концентрация, предсказанная программным обеспечением.

Третья строка определяет присутствующую примесь (белок, фенол, гуанидин-HCl или гуанидин-изотиоцианат).

Варианты применения спектрофотометров NanoDrop в производстве мРНК вакцин

Спектрофотометры NanoDrop One/OneC и спектрофотометр NanoDrop Eight улучшают контроль качества мРНК-вакцин на всех стадиях разработки или производства, что отражено на рисунке 3. Наряду с измерениями микрообъема приборы NanoDrop предоставляют полные спектральные данные за несколько секунд!

Благодаря программному обеспечению, установленному на спектрофотометрах NanoDrop One / OneC и спектрофотометре NanoDrop Eight, приборы готовы к внедрению в рабочий процесс производства или разработки мРНК-вакцин в лаборатории GMP.

NanoDrop One/One C Microvolume UV-VIS Спектрофотометр	NanoDrop One/One Eight Microvolume UV-VIS Спектрофотометр
Секвенирование	Получение плазмид	Синтез мРНК: in vitro транскрипция
Контроль чистоты и концентрации нуклеиновых кислот. Отсутствие погрешности измерения за счет идентификации загрязняющих веществ с помощью технологии Acclaro.	Измерение значения оптической плотности (OD600) для выделения плазмидной ДНК. Измерение концентрации пДНК, устранение проблем с последующими экспериментами с помощью проверки чистоты продукты на спектрофотометре NanoDrop.	мРНК очищена от контаминирующих транскрипционных материалов. Идентификация контаминирующих агентов с технологией Acclaro для уменьшения ингибирования трансляции белка.

Рис. 3. Использование NanoDrop при получении плазмидной ДНК или матричной РНК.

Информация для заказа:

Другие наноспектрофотометры (фотометры):

Салфетки безворсовые для протирки оптики: